2017年7月9日 星期日

細胞週期系列之三 細胞週期調節異常與腫瘤


  細胞週期系列之三  細胞週期調節異常與腫瘤

一、 原致癌基因(proto-oncogenes)以及腫瘤抑制基因(tumor suppressor genes

1980年代開始,科學家們陸續發現有兩類的基因,與腫瘤(tumors)的形成有關,也與細胞週期(the cell cycle)的異常相關。

1.原致癌基因(proto-oncogenes,表現之蛋白質參與細胞週期的正常運作。然而,如果這類原致癌基因發生突變,則變成了致癌基因(​​oncogenes,致癌基因表現之蛋白質,會導致細胞週期的異常,而可能因此形成腫瘤。




01. 原致癌基因(proto-oncogenes)因為致癌物質誘導,突變成致癌基因(​​oncogenes),致癌基因表現之蛋白質,將正常細胞轉型成癌細胞。

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2.腫瘤抑制基因(tumor suppressor genes,表現之蛋白質多為細胞週期的剎車分子。




02. 腫瘤抑制基因(tumor suppressor genes),表現之蛋白質(圖中綠色箭頭部分),可在細胞不同的反應部位踩剎車,停止細胞增生(cell proliferation)=停止細胞周期的進行。

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二、 Ras 原致癌基因

       原致癌基因以Ras原致癌基因為例:




03. Ras原致癌基因(Ras Proto-oncogenes),表現之產物是G蛋白G蛋白在由生長因子至細胞核(from growth factor to nucleus),訊號傳遞過程(signal transduction pathway)中,扮演著重要的角色。

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04. Ras原致癌基因突變,與大約30%的人類癌症有關。

Ras原致癌基因表現之Ras蛋白質是一種G蛋白,將細胞外生長因子(growth factor)的訊號,由細胞外傳送(relay)到細胞內,再進入一連串蛋白激酶的瀑布反應 (protein kinases cascade)中。

蛋白激酶的瀑布反應 (protein kinases cascade reaction)—是指一連串與蛋白激酶相關的化學反應。例如圖06.Ras蛋白活化Raf之後,RafMekErk就是蛋白激酶的瀑布反應

→代表磷酸化也代表活化。

也有人稱之為瀑布放大反應,是指譬如1Raf能活化10Mek10Mek又能活化100Erk的意思。







05. Ras原致癌基因發生誤訊or錯義突變(missense mutations),改變基因產物之性質,使得有絲分裂促進素活化之蛋白激酶瀑布反應(Mitogen-activated protein,MAP kinase cascade),無法再受到適當的調節,導致細胞過度增生,而可能形成腫瘤。

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06.

1兩分子表皮生長因子(Epidermal Growth Factor,EGF),與細胞膜上表皮生長因子接收器(Epidermal Growth Factor Receptor,EGF Recptor) 之兩次單位結合。

2將訊號傳送(relay)入細胞膜內層磷脂後,活化 Ras原致癌基因表現之G蛋白。

3經過有絲分裂促進素活化之蛋白激酶瀑布反應(MAP kinase cascade)

4活化轉錄因子(activation of transcription factors)

5刺激有關細胞增生之基因表現,加速表皮細胞的細胞週期→表皮細胞分裂之速度↑。

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三、腫瘤抑制基因(tumor suppressor genes

    視網膜母細胞瘤(retinoblastomaA cancer of the retina. Found most often in small children; this disease has been linked to the inheritance of mutated copies of the Rb tumor suppressor gene. For more information, see the entries on Rb and Tumor Suppressor., Rb)腫瘤抑制基因;p53腫瘤抑制基因為例,探討腫瘤抑制基因與細胞週期,與腫瘤產生的相關性。

基因名稱
p53
RB
基因發現於
    1979
    1986
基因位於
17染色體之短臂
    (17p13.1)
13染色體之長臂
    (13q14)
基因表現之產物
轉錄因子(Transcription Factor)
磷酸化之細胞核蛋白
主要功能
基因組的守護者
(The Guardian of the Genome)
細胞週期的主要剎車
(a Master Brake of the Cell Cycle)
詳細的功能
1.使細胞不再增生,修補受損DNA
2.DNA無法修補時,使細胞程式性細胞死亡=細胞凋亡(Apoptosis)
 3.抑制血管增生(anti-angiogensis),使癌細胞養分不足,而無法成長、轉移。
1. G1期,pRB的磷酸化程度低→pRBE2F結合→阻斷DNA合成基因之轉錄→阻斷細胞週期由G1期進入S期。(07.& 08.)
2. pRB磷酸化程度增加→pRBE2F分開→細胞週期由G1期進入S期→細胞增生。(08.)





07. 細胞週期之G1期,pRB蛋白質磷酸化程度低,與轉錄因子E2F結合,阻止細胞週期由G1進入S期。結果沒有有絲分裂發生(No Mitosis)

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08. 於細胞週期之G1期,磷酸化程度低之RB蛋白質,與轉錄因子E2F結合,阻止細胞週期由G1進入S(左圖)

磷酸化程度高之RB蛋白質(Phosphorylated Rb protein),與E2F轉錄因子分開,E2F促使S期相關的基因表現,使得細胞週期進入S(右圖)







09. p53是分子量五萬三千道爾敦(53 kDa)細胞核磷酸蛋白。由393胺基酸組成。此圖以不同顏色標示p53各部分之功能。

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10. 在正常的細胞核中,p53蛋白的濃度相當低(因為p53與細胞核中的Mdm2結合,形成p53- Mdm2複合體,離開細胞核,而由細胞質中之蛋白酶體(Proteasome)分解(左圖)

DNA損傷,p53蛋白磷酸化而成為轉錄因子(transcription factor),轉錄因子促使表現之基因,與DNA修補或程式性細胞死亡(Apoptosis)有關(右圖)

Mdm2p53-specific E3 Ubiquitin protein ligase

(Mdm2—專屬p53之范素蛋白連接酶)

p53蛋白的半衰期約為5分鐘,如此短的半衰期,來不及啟動p21基因表現即被分解;磷酸化後的p53蛋白,半衰期可長達45小時,因此可啟動p21基因表現,而抑制細胞週期由G1期進入S期。

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11. 上方為促使p53磷酸化的原因(八點)

1熱休克(Heat shock)

2代謝改變(Metabolic changes)

3缺氧(Hypoxia)

4核苷酸缺失(Nucleotide depletion)

5輻射(Ionizing radiation)

6致癌基因(Oncogenes)

7DNA損傷(DNA damage)

8端粒變短(Telomere shortening)

下方兩邊淡黃色框框,是經由p53調節產生之反應:

左下方框框

1凋亡(APOPTOSIS) =程式性細胞死亡(Programmed cell death)

2DNA修補(DNA REPAIR)

3細胞老化(SENESCENCE)

右下方框框

1細胞分化(DIFFERENTIATION)

2細胞週期停止(CELL-CYCLE ARREST)

圖的中間下方表達的概念,與圖10.相同。

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12. 正常p53蛋白(Normal p53)與突變p53蛋白(Mutated p53)之比較。

正常p53蛋白當DNA損傷(DNA damage)、細胞週期異常(Cell cycle abnormalities) 、缺氧(Hypoxia)時,會停止細胞週期來修補DNA,如DNA無法修補,則產生細胞凋亡(Apoptosis)

突變p53蛋白無法修補損傷的DNA、無法產生細胞凋亡、如果異常的細胞繼續分裂,最後可能導致細胞癌化(Cells with abnormal p53 can become cancerous)

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13. 慣例,在寫原致癌基因以及腫瘤抑制基因時,均以斜體字表示。而在寫原致癌基因以及腫瘤抑制基因表現之蛋白質時,均以正楷體字表示。例如以上表格中,紅色字體為代表性的腫瘤抑制基因(Tumor Suppressor Gene) 均為斜體字




2017年7月7日 星期五

細胞週期系列之二 — 細胞週期的調控


細胞週期系列之二    細胞週期的調控

一、 檢查點(Checkpoints)

    2001年諾貝爾生理醫學獎得主之一,美國的利蘭.哈特威爾(Leland Hartwell)提出「檢查點(checkpoint)」的觀念,認為細胞週期中有一些特定的關鍵時期(=檢查點),細胞分裂到檢查點時,必須符合某些特定的條件,細胞週期才會繼續,如此可確保細胞週期進行的正確無誤。

    在真核細胞的細胞週期中,有三個檢查點:

(1)    G1 checkpoint(又稱為限制點,Restriction Point),在G1 phase晚期,進入S phase前,主要檢查細胞的大小、營養狀態、生長因子、和DNA是否有損傷;

(2)    G2 checkpoint,第二個檢查點在G2 phase晚期,就是進入M phase前,主要檢查細胞的大小和DNA是否複製完全;

(3)    M Checkpoint (Spindle assembly checkpoint),第三個檢查點在M phase的過程中,主要檢查染色體的排列,以及染色體的中央節(centromere)是否附著於紡錘絲(Mitotic Spindle)上。



01. 細胞週期有三個檢查點。(The cell cycle is controlled at three checkpoints.)




二、週期素(Cyclins)以及週期素依賴性蛋白激酶(cyclin dependent kinaseCdk)

    2001年諾貝爾生理醫學獎三位得主:美國的利蘭.哈特威爾(Leland Hartwell)以及英國的保羅.納斯(Paul Nurse)和蒂莫漢特(Timothy Hunt)研究發現,在細胞週期中有兩個關鍵因素,組成檢查點的開關(Checkpoint Switches)

檢查點的開關基本上是一種異質雙體激酶(heterodimer kinases),而雙體(dimer)是由以下兩部分組成:

1. 週期素(Cyclin)—調節的次單位(regulatory subunit),以濃度的高低,調節週期素依賴性蛋白激酶(Cdk)的活性。

2. 週期素依賴性蛋白激酶(cyclin dependent kinaseCdk) —催化的次單位(catalytic subunit)

1Cdk中的某些位點與週期素結合,

2Cdk中的另一些位點也被磷酸化之後,Cdk才具備完全的活性,具有將受質的蛋白質磷酸化之功能。

       
細 胞 中 的 濃 度
功能
週期素(Cyclins)

隨細胞週期的進行,會產生不同種類的週期素,而且濃度有週期性的變化。(02)
Cdk結合後→才能使Cdk產生活性。
週期素依賴性蛋白激酶(cyclin dependent kinaseCdk)
細胞週期的整個過程中,濃度恆定無變化。
啟動DNA的複製以及誘發細胞的有絲分裂,從而趨動細胞周期的進行。

Cdk的周期性激活與失去活性,是推動細胞週期進行的主要因素。CDK激酶分子中存在著一些重要位點,而對這些位點進行磷酸化修飾,是使CDK激酶產生活性的重要調節作用(參考圖05 )

(Cyclin-dependent kinases (CDK) belong to a group of protein kinases originally discovered as being involved in the regulation of the cell cycle.

The cell-cycle control system is based on cyclically activated protein kinases. )




02. 細胞周期檢查點的開關(checkpoint switches)是由以下兩部分組成:

1週期素(Cyclin)

2週期素依賴性蛋白激酶(Cdk)兩者結合後→才能使Cdk產生活性。

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03. 隨著細胞週期的進行,會產生不同種類的週期素(Cyclins),而且週期素濃度有週期性的變化。

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04. 脊椎動物以及出芽性酵母菌之主要的週期素(Cyclins)和週期素依賴性蛋白激酶(Cdk)

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05. 期素依賴性蛋白激酶(Cdk)活化之步驟。

1與適當之週期素(Cyclin)結合。

2蛋白激酶(protein kinases)磷酸化Cdk的某些位點。添加抑制性的磷酸根(inhibitory phosphate)及促進性的磷酸根(activating phosphate)

3活化的蛋白磷酸酶(activating protein phosphatase)切除抑制性的磷酸根(inhibitory phosphate)→週期素-期素依賴性蛋白激酶複合體具有完全的活性。

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三、週期素(Cyclins)如何被降解(degradation)



06. 期素濃度(cyclin concentration)升高,引發期素依賴性蛋白激酶(Cdk)的活化。但期素完成任務之後,經由泛素化作用(Ubiquitylation),在蛋白酶體(proteasome)中被快速的降解。

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07. 期素與范素(Ubiquitin)結合,而於蛋白酶體(proteasome)中被快速的分解。

※蛋白酶體(proteasome)是細胞內除溶素體(Lysosome)外的蛋白質分解構造,是細胞調節特定數量蛋白質和移除摺疊錯誤蛋白質的場所。

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08. 期素(cyclin)與范素(Ubiquitin)結合,而於蛋白酶體(proteasome)中被快速的分解之一例。

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四、Cdk抑制蛋白(Cdk inhibitor proteinsCKIs)

    在細胞週期要進入S期之前,有數種Cdk抑制蛋白(CKIs),能抑制期素依賴性蛋白激酶(Cdk)的活性,進而抑制細胞週期進入S

    試舉p21蛋白為例,p21蛋白就是一種Cdk抑制蛋白(Cdk inhibitor protein)

    DNA因受X–光照射而損傷(DNA damage)→活化蛋白激酶(protein kinases) 磷酸化轉錄因子p53→活化之p53蛋白使p21基因開始表現p21蛋白 →進而抑制Cdk的活性,避免在修補好DNA損傷之前,即進入S期。



p53蛋白的半衰期約為5分鐘,如此短的半衰期,來不及啟動p21基因表現即被分解;磷酸化的p53蛋白半衰期可長達45小時,可啟動p21基因表現,而抑制細胞分裂由G1期進入S期。




09. DNA因受X–光照射而損傷(DNA damage)→活化蛋白激酶(protein kinases) 磷酸化轉錄因子p53磷酸化之p53蛋白使p21基因開始表現p21蛋白(Cdk抑制蛋白) →進而抑制Cdk的活性→使得細胞週期停止於G1期無法進入S期。

p53 is involved in preventing the cell from passing from the G1 phase of the cell cycle to S phase if there is damage to the cell's DNA.


    如果p53基因突變,則當DNA損傷時,無法讓p21基因表現p21蛋白(Cdk抑制蛋白),則細胞週期不會停止,最後複製DNA損傷的子細胞,而產生程式性的細胞死亡=凋亡(programmed cell death apoptosis)




10. p53基因突變,則當DNA損傷時,無法讓p21基因表現p21蛋白(Cdk抑制蛋白),則細胞週期不會停止,最後複製的子細胞,產生程式性的細胞死亡(apoptosis)

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